Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms