Protein–RNA interactions for Protein: O35664

Ifnar2, Interferon alpha/beta receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar2O35664 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifnar2O35664 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifnar2O35664 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms