Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms