Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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