Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcc1O35379 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms