Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn1O35350 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn1O35350 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn1O35350 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms