Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kpna6O35345 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms