Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kpna3O35344 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms