Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Kpna4O35343 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms