Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NmiO35309 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NmiO35309 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NmiO35309 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NmiO35309 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NmiO35309 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NmiO35309 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NmiO35309 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NmiO35309 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NmiO35309 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NmiO35309 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NmiO35309 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NmiO35309 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NmiO35309 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NmiO35309 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NmiO35309 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NmiO35309 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NmiO35309 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NmiO35309 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NmiO35309 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NmiO35309 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NmiO35309 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NmiO35309 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NmiO35309 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NmiO35309 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NmiO35309 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NmiO35309 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NmiO35309 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NmiO35309 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NmiO35309 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NmiO35309 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NmiO35309 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NmiO35309 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NmiO35309 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NmiO35309 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NmiO35309 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NmiO35309 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NmiO35309 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NmiO35309 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NmiO35309 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NmiO35309 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NmiO35309 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NmiO35309 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NmiO35309 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NmiO35309 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NmiO35309 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NmiO35309 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NmiO35309 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NmiO35309 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NmiO35309 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NmiO35309 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NmiO35309 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NmiO35309 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NmiO35309 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NmiO35309 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NmiO35309 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NmiO35309 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NmiO35309 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NmiO35309 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NmiO35309 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NmiO35309 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NmiO35309 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NmiO35309 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NmiO35309 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NmiO35309 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NmiO35309 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NmiO35309 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NmiO35309 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NmiO35309 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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NmiO35309 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NmiO35309 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NmiO35309 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NmiO35309 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NmiO35309 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NmiO35309 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NmiO35309 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NmiO35309 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NmiO35309 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NmiO35309 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NmiO35309 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NmiO35309 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NmiO35309 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NmiO35309 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NmiO35309 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NmiO35309 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NmiO35309 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NmiO35309 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NmiO35309 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NmiO35309 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NmiO35309 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NmiO35309 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NmiO35309 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NmiO35309 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NmiO35309 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NmiO35309 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NmiO35309 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NmiO35309 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NmiO35309 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NmiO35309 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms