Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Nedd9O35177 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Nedd9O35177 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Nedd9O35177 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Nedd9O35177 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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Nedd9O35177 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Nedd9O35177 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Nedd9O35177 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nedd9O35177 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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