Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Polr1aO35134 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms