Protein–RNA interactions for Protein: O09061

Psmb1, Proteasome subunit beta type-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb1O09061 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmb1O09061 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms