Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EllO08856 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EllO08856 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EllO08856 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EllO08856 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EllO08856 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EllO08856 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EllO08856 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EllO08856 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EllO08856 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EllO08856 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EllO08856 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EllO08856 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EllO08856 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EllO08856 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EllO08856 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EllO08856 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EllO08856 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EllO08856 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EllO08856 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EllO08856 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EllO08856 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EllO08856 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EllO08856 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EllO08856 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EllO08856 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EllO08856 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EllO08856 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EllO08856 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EllO08856 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EllO08856 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EllO08856 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EllO08856 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EllO08856 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EllO08856 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EllO08856 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EllO08856 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms