Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms