Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClockO08785 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClockO08785 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ClockO08785 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClockO08785 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClockO08785 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ClockO08785 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClockO08785 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClockO08785 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ClockO08785 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ClockO08785 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ClockO08785 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClockO08785 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClockO08785 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClockO08785 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClockO08785 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClockO08785 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClockO08785 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ClockO08785 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClockO08785 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ClockO08785 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ClockO08785 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ClockO08785 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClockO08785 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClockO08785 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClockO08785 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClockO08785 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClockO08785 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClockO08785 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClockO08785 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClockO08785 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClockO08785 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClockO08785 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClockO08785 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClockO08785 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClockO08785 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClockO08785 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClockO08785 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClockO08785 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms