Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MttpO08601 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MttpO08601 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MttpO08601 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MttpO08601 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MttpO08601 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MttpO08601 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MttpO08601 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MttpO08601 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MttpO08601 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MttpO08601 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MttpO08601 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MttpO08601 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MttpO08601 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
MttpO08601 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MttpO08601 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MttpO08601 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MttpO08601 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms