Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms