Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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