Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm5225J3QPL3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm5225J3QPL3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm5225J3QPL3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5225J3QPL3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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