Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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