Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21976J3QNN2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21976J3QNN2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms