Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17577J3QNF7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17577J3QNF7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17577J3QNF7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17577J3QNF7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17577J3QNF7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17577J3QNF7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17577J3QNF7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17577J3QNF7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17577J3QNF7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17577J3QNF7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17577J3QNF7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17577J3QNF7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17577J3QNF7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm17577J3QNF7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm17577J3QNF7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17577J3QNF7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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