Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm21972J3QN38 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21972J3QN38 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21972J3QN38 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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