Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Zfp616J3QN14 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Zfp616J3QN14 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Zfp616J3QN14 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp616J3QN14 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms