Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930544D05RikJ3QK56 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms