Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20830J3KML6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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