Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm29394H3BIW7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms