Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Taf4bG5E8Z2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf4bG5E8Z2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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