Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn20G5E8X0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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