Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubgcp6G5E8P0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubgcp6G5E8P0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubgcp6G5E8P0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubgcp6G5E8P0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubgcp6G5E8P0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubgcp6G5E8P0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tubgcp6G5E8P0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubgcp6G5E8P0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubgcp6G5E8P0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubgcp6G5E8P0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubgcp6G5E8P0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubgcp6G5E8P0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubgcp6G5E8P0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms