Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933406M09RikG3XA12 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms