Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r58G3X9U3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms