Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubap1lG3UW59 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubap1lG3UW59 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms