Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ScaperF8VQ70 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ScaperF8VQ70 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms