Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6F8VPZ5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ercc6F8VPZ5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms