Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M1F7CXU4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms