Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Igkv1-99F6XWB2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms