Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Crocc2F6XLV1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Crocc2F6XLV1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms