Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf212F6TQD1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf212F6TQD1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf212F6TQD1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf212F6TQD1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf212F6TQD1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf212F6TQD1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf212F6TQD1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf212F6TQD1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf212F6TQD1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf212F6TQD1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf212F6TQD1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf212F6TQD1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf212F6TQD1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf212F6TQD1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf212F6TQD1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf212F6TQD1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf212F6TQD1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf212F6TQD1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf212F6TQD1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf212F6TQD1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf212F6TQD1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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