Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Raph1F2Z3U3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms