Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms