Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms