Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Gm5407E9Q7Q1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Gm5407E9Q7Q1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm5407E9Q7Q1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm5407E9Q7Q1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm5407E9Q7Q1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm5407E9Q7Q1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm5407E9Q7Q1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm5407E9Q7Q1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm5407E9Q7Q1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm5407E9Q7Q1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Gm5407E9Q7Q1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5407E9Q7Q1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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