Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Urb2E9Q7L1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms