Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Arhgef5E9Q7D5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Arhgef5E9Q7D5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Arhgef5E9Q7D5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Arhgef5E9Q7D5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Arhgef5E9Q7D5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Arhgef5E9Q7D5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Arhgef5E9Q7D5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Arhgef5E9Q7D5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Arhgef5E9Q7D5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Arhgef5E9Q7D5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Arhgef5E9Q7D5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms