Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700024B05RikE9Q6D7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700024B05RikE9Q6D7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms