Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm20518E9Q548 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm20518E9Q548 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm20518E9Q548 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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