Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms