Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms